研判祸首是一颗来自外太空的星体(彗星或小行星)，在当地上空爆炸，完全崩解汽化，因此未产生陨石坑。后续调查发现当地留下许多玻璃微粒，其中含有铱与镍等陨石富含的成分，显示的确来自太空。
主流解释是：一颗巨大的流星体或彗星在进入大气层时发生了爆炸。但没有找到陨石碎片和撞击坑，因此科学家对究竟是什么造成了所谓的「通古斯事件」，还是感到非常迷惑。
许多UFO迷则认为，这场爆炸是因为外星飞船核爆或解体造成的。美国经典电视影集《X档案》，有一集的主题就是通古斯事件。
不过外媒报导，俄罗斯科学院的研究人员佐洛宾(Andrei E. Zlobin)最近宣称他已经找到通古斯事件的陨石碎片。
佐洛宾表示，他收集到的这些石块带有明显的融化痕迹，这是当它们高速进入地球大气层时产生的高温造成的特征。根据他的计算，通古斯爆炸释放的热量还不足以融化地球表面的岩石，因此他收集到的陨石碎片，一定是在火球内部形成的。这项发现还需通过化学分析的进一步确认，因为它 仍存在一些无法解释的问题。如果能够进一步得到确认，那么这些陨石能够帮助科学家最终确定造成通古斯事件的真正原因。
