对于月球的起源，科学家提出3种理论，它们全都有缺陷，但是阿波罗计划却有助于证明，其中看来可能性最小的理论是最佳理论。
1、月球起源之谜
有些科学家认为，月球是和地球一起，于46亿年以前，从一团宇宙尘埃中生成的。另一种理论认为月球是地球的孩子，也许是从太平洋地区抠出去的。然而阿波罗登月探险的结果表明，地球和月球的结构成分差别很大，有一些科学家提出了另一种假说，即俘获说。他们认为，月亮是偶然闯入地球引力场，而被锁定在目前的轨道上。
月球起源现在还是谜
可是，要从理论上解释这一过程的机制，难度相当大。因此，上述3种理论全都难以站得住脚。正如罗宾·布列特博士所称：要解释月球不存在，要比解释月球存在更容易些。
2、物袭月球时发出怪声之谜
在阿波罗探险过程中，废弃的火箭第三节推进器会轰地一下撞在月球表面。据美国航空航天局的文件记载，每一次这样的响声，听起来仿佛是一个大铃铛的声音。当登月人员降落在颜色特别黑的平原上时，他们发现要在月球表面钻孔十分困难。
土壤样品经分析后发现，其中含有大量地球上稀有的金属钛（它被用于超音速喷气机和宇宙飞船上）；另一些硬金属，如锆，铱、铍的含量也很丰富。科学家觉得迷惑不解，因为这些金属只有在很高的温度———约华氏4500度下，才会和周围的岩石融为一体。
